V organizme dospelého človeka sa vyskytuje 105 g chlóru vo forme chloridových iónov. Najviac ich je v krvi, mozgomiechovom moku a iných telových tekutinách, v obličkách, koži, podkožnom tkanive, svaloch a pečeni. Sú prítomné aj v žalúdočnej šťave ako zložka kyseliny chlorovodíkovej. Vylučovanie kyseliny chlorovodíkovej v žalúdku je sprevádzané poklesom koncentrácie chloridových iónov v krvi. Chloridové ióny predstavujú 2/3 všetkých iónov v krvi. Koncentrácia chloridových iónov v mozgomiechovom moku (4,40 g⋅dm−3) je vyššia, než v iných telových tekutinách, dokonca vyššia, než v sekrétoch tráviaceho traktu.